Rcpp Version 0.12.12
cppFunction.R
Go to the documentation of this file.
1 
2 library(Rcpp)
3 
4 cppFunction('
5  NumericVector convolveCpp(NumericVector a, NumericVector b) {
6 
7  int na = a.size(), nb = b.size();
8  int nab = na + nb - 1;
9  NumericVector xab(nab);
10 
11  for (int i = 0; i < na; i++)
12  for (int j = 0; j < nb; j++)
13  xab[i + j] += a[i] * b[j];
14 
15  return xab;
16  }
17 ')
18 
19 convolveCpp(c(1,2,3), matrix(3,3))
20 
21 
22 cppFunction(depends='RcppArmadillo', code='
23  List fastLm(NumericVector yr, NumericMatrix Xr) {
24 
25  int n = Xr.nrow(), k = Xr.ncol();
26 
27  arma::mat X(Xr.begin(), n, k, false); // reuses memory and avoids copy
28  arma::colvec y(yr.begin(), yr.size(), false);
29 
30  arma::colvec coef = arma::solve(X, y); // fit model y ~ X
31  arma::colvec resid = y - X*coef; // residuals
32 
33  double sig2 = arma::as_scalar( arma::trans(resid)*resid/(n-k) );
34  // std.error of estimate
35  arma::colvec stderrest = arma::sqrt(
36  sig2 * arma::diagvec( arma::inv(arma::trans(X)*X)) );
37 
38  return List::create(Named("coefficients") = coef,
39  Named("stderr") = stderrest
40  );
41 }
42 ')
43